着丝点与着丝粒既有区别又有联系。着丝粒也叫主缢痕，是指染色体主缢痕部位的染色质，是一种高度有序的整合结构，在结构和组成上都是非均一的，至少包括三种不同的结构域：沿着着丝粒外表面的动力结构域（由两类蛋白和着丝粒DNA 组成），中央结构域（由串联重复的卫星DNA 组成），位于着丝粒内表面的配对结构域。着丝粒将染色体分成二臂，在细胞分裂前期和中期，把两个姐妹染色单体连在一起，到后期两个染色单体的着丝粒分开。
着丝点又称为动粒，是由着丝粒结合蛋白在有丝分裂期间特别装配起来的、附着于主缢痕外侧的圆盘状结构。动粒的外侧主要用于纺锤体微管附着，内侧与着丝粒相互交织。每条中期染色体上含有两个动粒，分别位于着丝粒的两侧。细胞分裂后，两个动粒分别被分配到两个子细胞中。当细胞再次进入S期后，动粒又会重新复制。动粒从内到外可分为三层结构，即内层、中层和外层。内层直接与着丝粒联结，外层直接与动粒微管联结。染色体依靠动粒捕捉由纺锤体极体发出的微管。没有动粒的染色体不能与纺锤体微管发生有机联系，也不能和其他染色体一起向两极运动。
因此，着丝点和着丝粒并非同一结构，它们的功能也不同，但它们的位置关系是固定的，二者结构成分相互穿插，在功能方面联系密切，因而常被合称为着丝粒—动粒复合体。
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