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1、脯氨酸是不符合结构通式的组成蛋白质的氨基酸
组成蛋白质的氨基酸指的是在翻译过程中作为原料参与蛋白质合成的氨基酸。在教学过程中，有些教师将组成蛋白质的氨基酸认为是蛋白质水解得到的氨基酸，这种说法是不正确的。除脯氨酸外，组成蛋白质的氨基酸都可以用图1所示结构通式来表示。
这些氨基酸在结构上的共同点是与羧基相邻的α-碳原子上都有一个氨基，因此称为α-氨基酸。 连接在α-碳上的还有一个氢原子和一个侧链基团，侧链基因称为R基。各种氨基酸之间的区别在于R基的不同。 脯氨酸与一般的α-氨基酸不同，它没有自由的α-氨基，是一种α-亚氨基酸。脯氨酸的结构式见图2。 
2、并不是符合结构通式的氨基酸都是组成蛋白质的氨基酸 例1：下列物质中，属于构成蛋白质的氨基酸的是（ ） 
此题正确答案是Ａ，Ａ项是甘氨酸。Ｂ项不符合氨基酸的结构通式，可以确认Ｂ（Ｐ－丙氨酸）不是组成蛋白质的氨基酸。Ｃ项满足氨基酸的结构通式，但它是鸟氨酸，在蛋白质组成中并不存在。Ｄ项是羟脯氨酸，它并不作为原料参与蛋白质的合成，所以也不属于组成蛋白质的氨基酸。也就是说，组成蛋白质的氨基酸都符合氨基酸的结构通式（脯氨酸例外），但符合结构通式的物质并不一定是组成蛋白质的氨基酸。目前发现的组成蛋白质的氨基酸只有２２种，它们的Ｒ基都是确定的。所以，要正确认识组成蛋白质的氨基酸，避免命题错误和教学失误。
3、为什么有的氨基酸能溶于水，而有的不能？
各种组成蛋白质的氨基酸之间的区别在于Ｒ基的不同。有的氨基酸能溶于水，而有的不能，是因为它们的Ｒ基不同。例如，苯丙氨酸极难溶于水，是因为它的侧链是非极性的，且其水溶过程伴随着熵减少，因此不易进行。而丝氨酸则易溶于水，是因为它的侧链含有极性的羟基，可以与水形成氢键，故极易溶于水。
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