1.显微观察法——观察多种多样的细胞、观察线粒体和叶绿体、观察细胞有丝分裂、观察细胞减数分裂、观察质壁分离和复原、观察染色体变异等

2.差速离心法——分离各种细胞器、制备细胞膜等

3.对比实验法——设置两个或两个以上的实验组通过对结果的比较分析，探究某种因素对实验结果的影响，如“探究酵母菌细胞呼吸的方式”及“酶作用特性相关实验”等

4.密度梯度离心法——用15N标记DNA，证明DNA半保留复制(重带、轻带、中带等)

5.细胞染色法——活细胞染色(健那绿染色线粒体)；碘染色法，证明光合作用产生淀粉；死细胞染色(醋酸洋红、龙胆紫、改良苯酚品红染液、吡罗红甲基绿染色剂)；台盼蓝染色法鉴定细胞死活

6.同位素标记法——分泌蛋白的合成与运输；探究光合作用中释放的氧气的来源；暗反应中碳元素去向14CO2→14C3→(14CH2O)；噬菌体侵染细菌实验(32P、35S)；基因诊断等

7.纸层析法——绿叶中色素的分离(选修1，胡萝卜素的提取与鉴定)

8.梯度设置实验——探究生长素类似物对扦插枝条生根的最适浓度，探究影响酶活性的最适温度和最适pH

9.假说—演绎法——孟德尔两大遗传定律的发现，摩尔根证明基因在染色体上(用白眼雄果蝇为材料)，DNA半保留复制方式的证明 

10.类比推理法——萨顿提出“基因在染色体上”

11.样方法——估算植物及活动能力弱的动物(如蚯蚓、蚜虫)等种群密度

12.标志重捕法——估算活动能力强的动物种群密度

13.取样器取样法——探究土壤中小动物类群丰富度